GbParser App for iPhone - Free Download GbParser for iPhone at AppPure

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Update Date

2017-10-05

Size

12.6 MB

GbParser Description

- 概要
iPhoneアプリ「ファイル」からGenbank fileを読み込みパースします。Feature, Qualifierをパースした結果をタブ区切りテキスト形式でエクスポートすることが出来ます。また、translation、originの配列をfasta fileにエクスポートすることが出来ます。

- 使い方
(1)iPhoneアプリ「ファイル」からgenbank fileを選択します。
(2)変換アイコンをタップするとパースを実行します。
(3)パース結果ファイル名をタップすると入力ファイルと同じフォルダにエクスポートされます。

- パース結果の出力書式
Feature, Qualifierのパース結果（タブ区切りテキスト）
列番号、項目
1 #locus
2 feature key
3 location
4 direction　complementのとき'R' それ以外は'F'
5 min_Position　location内の最小値
6 以降 Qualifier項目

translation fasta file のヘッダ
>[locus id]|[location]|locus_tag:[locus_tag]|gene:[gene id]|protein_id:[protein id]

origin fasta fileのヘッダ
>[locus id]

GbParser

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