GbParser

Free

1.0for iPhone

Tomoo Inden

Developer

Oct 5, 2017

Update Date

Utilities

Category

App Store

Age Rating

Apps in this category do not contain restricted content.

Apps in this category may contain mild or occasional cartoon, fantasy or real-life violence, as well as occasional or mild adult, sexually suggestive or horrifying content and may not be suitable for children under 9 years of age.

12+

Apps in this category may contain occasional mild indecent language, frequent or intense cartoon or real-life violence, minor or occasional adult or sexually suggestive material, and simulated gambling, and may be for children under 12 years of age.

17+

You must be at least 17 years old to access this App.

Apps in this category may contain frequent and intense offensive language; Frequent and intense cartoon, fantasy or realistic violence: frequent and intense adult, scary and sexually suggestive subjects: as well as sexual content, nudity, tobacco, alcohol and drugs, may not be suitable for children under 17 years of age.

GbParser Screenshots

iPhone

About GbParser

- 概要
iPhoneアプリ「ファイル」からGenbank fileを読み込みパースします。Feature, Qualifierをパースした結果をタブ区切りテキスト形式でエクスポートすることが出来ます。また、translation、originの配列をfasta fileにエクスポートすることが出来ます。

- 使い方
(1)iPhoneアプリ「ファイル」からgenbank fileを選択します。
(2)変換アイコンをタップするとパースを実行します。
(3)パース結果ファイル名をタップすると入力ファイルと同じフォルダにエクスポートされます。

- パース結果の出力書式
Feature, Qualifierのパース結果（タブ区切りテキスト）
列番号、項目
1 #locus
2 feature key
3 location
4 direction　complementのとき'R' それ以外は'F'
5 min_Position　location内の最小値
6 以降 Qualifier項目

translation fasta file のヘッダ
>[locus id]|[location]|locus_tag:[locus_tag]|gene:[gene id]|protein_id:[protein id]

origin fasta fileのヘッダ
>[locus id]